Buhgalter911

Покупець сплатив нам пеню за несвоєчасний розрахунок за поставлену продукцію, але меншу ніж за розрахунком, так домовились з директором. Підкажіть, будь ласка, чи нормально, що в мене розрахунок один, а сплата - інша. І на цю суму я нараховує єдиний податок 3%, а ПДВ не рухаю, правильно?

Что за розрахунок? Претензия согласована в каком размере? Вот такой и перечислять/облагать нужно.
Ну в любом случае так как Вы ЕН, то облагаете поступившее по факту.
НДС не трогаем.

Розрахунок пені в мене інша сума, ніж лист-претензія (претензію виставили на компромісну суму). Чи так можна, чи не буде виникати питань в податківців?

Можно, насчитать на контрагента штрафы можно по своему усмотрению.
Претензий у налоговиков не должно быть, все ок.