Да. Пробиваете возвратный (расходный) чек (только не служебную выдачу!).
2. "Как это все дело должно отражаться в КУРО"
Оборот в КУРО записываете за вычетом сумм ошибочных чеков.
При желании сумму ошибочных чеков фиксируете в столбце № 8 (с примечанием "ошибочные суммы" или т. п.).
3. "...и нужны ли акты?"
Да.
4. "И самое главное: эти возвратные чеки я не сохраняла (они были выброшены)! Чем, какими штрафами это грозит?"
Ничем - сами чеки зачастую не нужны. Реквизиты утерянных чеков возьмите с контрольной ленты.