Например здесь - Бухгалтерский учет НДС в программе 1С 8.2: там рассматривают слегка и теорию, и учетные вопросы.
Далее можно уже будет переходить к разделу пятому НКУ - почитайте как сам раздел, так и научно-практические комментарии - они хоть уже и устарели немного, но там есть весьма дельные мысли.