Для расчета сумм налога на доходы физических лиц, подлежащих возврату налогоплательщику из бюджета в связи с реализацией им права на налоговую скидку, применяется сумма уплаченного, то есть зачисленного в соответствующий бюджет налога, а не начисленного (удержанного) налоговым агентом.
Итак, если налоговый агент удержал, но не перечислил налог на доходы физических лиц в бюджет, то физическое лицо не имеет права на налоговую скидку.