Резидент или постоянное представительство нерезидента, осуществляющие в пользу нерезидента или уполномоченного им лица (кроме постоянного представительства нерезидента на территории Украины) любую выплату из дохода с источником его происхождения из Украины, полученного таким нерезидентом от осуществления хозяйственной деятельности (в том числе на счета нерезидента, которые ведутся в национальной валюте), удерживают налог с таких доходов, указанных в п.п. 141.4.1 НКУ, по ставке в размере 15% (кроме доходов, указанных в подпунктах 141.4.3 - 141.4.6 и 141.4.11 НКУ) их суммы и за их счет, который уплачивается в бюджет во время такой выплаты, если иное не предусмотрено положениями международных договоров Украины со странами резиденции лиц, в пользу которых осуществляются выплаты, которые вступили в силу.
Нормы определены п.п. 141.4.2 НКУ.
Если международным договором, согласие на обязательность какого предоставлено Верховной Радой Украины, установлены иные правила, чем предусмотренные НКУ, применяются правила международного договора (п. 3.2 НКУ).
Порядок применения международного договора Украины об избежании двойного налогообложения относительно полного или частичного освобождения от налогообложения доходов нерезидентов с источником их происхождения из Украины регулируется ст. 103 НКУ.
Ответственность за полноту удержания и своевременность перечисления в бюджет налога, указанного, в частности в п. 141.4 НКУ, возлагается на налогоплательщиков, осуществляющих соответствующие выплаты (п. 137.3 НКУ).
Следовательно, при выплате дохода нерезиденту неприбыльной организацией на такую неприбыльную организацию возложена обязанность по удержанию налога с доходов нерезидента, который перечисляется в бюджет.