Гоструда осуществляет контроль за соблюдением требований законодательства в сфере охраны и гигиены труда и принимает участие в организации обязательных медицинских осмотров в рамках определенных полномочий.
В частности, врач по гигиене труда территориального органа Гоструда согласовывает Перечень категорий работников, которые подлежат обязательным медицинским осмотрам, согласовывает поименный список работников, которые подлежат прохождению периодического медицинского осмотра, а также получает и подписывает Заключительный акт по результатам периодического медицинского осмотра работников.
В то же время Гоструда не проводит медицинских осмотров, не осуществляет лечение и не заменяет функции учреждений здравоохранения. Ее роль заключается в обеспечении соблюдения установленного порядка и защите прав работников на безопасные и здоровые условия труда.