Міністерство доходів та зборів України відзначає, що існуючий на сьогодні порядок реєстрації податкових накладних в Єдиному реєстрі податкових накладних є ефективним з точки зору адміністрування податку на додану вартість та попередження формування схемних кредитів з відшкодування цього податку.
Кількість платників, які здійснили реєстрацію податкових накладних в Єдиному реєстрі у 2012 році, зросла більш ніж у 5,5 рази та складає 133,6 тис. платників (у 2011 році реєстрували податкові накладні 23,5 тис. платників).
У разі, якщо підприємство заявляє кредит за незареєстрованою накладною, йому автоматично надсилається електронне повідомлення. Таким чином, у платника є час і можливість, щоб виправити допущені технічні помилки та уникнути їх у майбутньому. Про ефективність сервісу говорить той факт, що з травня 2012 року, коли система почала працювати, кількість надісланих повідомлень зменшилася більш ніж вдвічі – з 7 до 3 тис.
На думку фахівців Міндоходів, існуюча система реєстрації податкових накладних у Єдиному реєстрі не потребує змін, які, зокрема, запропоновані у законопроекті №2034 «Про внесення змін до Податкового кодексу України (щодо удосконалення деяких положень Податкового кодексу України)».
Відмова від принципу обов`язковості реєстрації податкової накладної при формуванні податкового кредиту та надання платнику можливості претендувати на податковий кредит, навіть якщо його контрагент не вніс накладну до реєстру, може призвести до значних махінацій із формуванням податкового кредиту і, як наслідок, до втрат державного бюджету через формування «схемних кредитів» на відшкодування ПДВ.