Чи можна враховувати податкову накладну, в якій у графі „Номенклатура” є запис „авансовий платіж”?

Ні, не можна. Вам повинні були виписати податкову накладну, яка включає номенклатуру товару. Це зазначено у підпункті 7.2.1 Закону України від 03.04.97 р. №168/97-ВР „Про податок на додану вартість”. Якщо неможливо розділити номенклатуру товару за податковими накладними на аванс і на доплату за видами товарів, то допускається ділення суми за кожним найменуванням товару пропорційно співвідношенню суми авансу до її повної вартості.