Відповідно до пункту 2.1 Інструкції про порядок обчислення і справляння збору за спеціальне використання водних ресурсів і збору за користування водами для потреб гідроенергетики і водного транспорту, затвердженої наказом Мінфіну України, ДПА України, Мінекономіки України та Мінекобезпеки України від 01.10.99 №231/539/118/219 із змінами і доповненнями, (далі – Інструкція №231) платниками збору за спеціальне використання водних ресурсів є підприємства, установи та організації незалежно від форми власності, їх філії, відділення, інші відособлені підрозділи, а також громадяни-суб'єкти підприємницької діяльності, що використовують водні ресурси (водокористувачі).
Пунктом 4.8 Інструкції №231 визначено, що збір за воду не справляється, зокрема, за воду, що використовується для задоволення питних і санітарно-гігієнічних потреб населення, в тому числі для задоволення виключно власних питних і санітарно-гігієнічних потреб підприємств, установ, організацій незалежно від форми власності та громадян-суб'єктів підприємницької діяльності.
Таким чином, якщо бюджетною організацією використовується вода виключно для задоволення питних і санітарно-гігієнічних потреб то збір за використання водних ресурсів не стягується